Готовність інкубатора до роботи можна виразити одним словом - "чистота". Це дійсно важливо, забезпечити 100% чистоту інкубатора (навіть якщо ви тільки принесли його з магазину). Найменший ознака бруду повинен бути видалено, оскільки він може представляти потенційну загрозу в процесі виведення пташенят. Причина проста – працююча машина створює вологе і тепле середовище всередині інкубатора, що дає ідеальні умови для розмноження бактерій.
Для того, щоб полегшити собі чистку машини, зніміть з неї якомога більше частин. Легко знімаються піддони для яєць і ємності для води. Мити рекомендується за допомогою спеціальних засобів, які можна купити у продавців обладнання для птахівництва (наприклад Бар'єр В1 - але тільки сильно розбавлений). При чищенні внутрішніх частин приладу повинні враховуватися запобіжні заходи, щоб уникнути пошкодження потенційно чутливих компонентів, таких як вентилятор, електричний мотор або термометр.

Перед складанням всі частини інкубатора повинні бути висушені повітряним методом.

Перед тим, як закладати яйця, включіть і залиште інкубатор працювати на холостому режимі на, як мінімум, 24 години. Потім, упевнившись, що машина підтримує задану температуру, рівень вологості, - можна приступати до закладки яєць.